Nature:新冠患者转为重症的预警位点被发现
2021-12-13 04:45:44 来源: 常州京城牛皮癣研究院 咨询医生
COVID-19病病症的观感可以从无症状携带、轻症到需要呼吸机甚至游离膜肺氧合(ECMO)维持永生的危加护病症,这其中的的这两项历史性状况依然有待密码。同时,新型冠状大肠杆菌是否是在传播过程中的牵涉到显着的基因突变,导致大肠杆菌毒力和传染性的变动,也严重不足进一步数据分析。
自禽传染病爆发之后,复旦大学附属武汉市公共医疗卫生病理教育中的心(都有简称公卫教育中的心)与转化医学国家重大科技基础交通设施(武汉)(都有简称交通设施)、武汉血液学数据分析所、医学基因学国家重点研究中心、瑞金医院病理大肠杆菌学研究中心,复旦大学武汉医学院分子大肠杆菌研究中心、武汉交通大学医学院附属同仁医院、中的科院寄生植物生理反应生态数据分析所、武汉阿佩尔数据分析所和武汉营养与肥胖数据分析所等单位通力合作,就新型冠状大肠杆菌基因、分子疟疾学在结构上、哮喘病理特征进行了深入数据分析。
5月20日,《Nature》杂志发表了这一他的团队的最新数据分析结果。除此以外,公医疗卫生教育中的心卢洪洲教授与交通设施主任陈赛娟博士生领衔的联合攻关他的团队,收集了公卫教育中的心在2020年1月20日-2月25日期间收治的326则有病症标本,对大肠杆菌基因变异、病理观感在结构上和抗体变动等数据集进行了全面深度分析。
数据分析他的团队借助于技术方法,高质量完成了112则有新冠大肠杆菌基因测序、组装和解析。他们基于大肠杆菌基因数列的进化树分析发现,新冠大肠杆菌主要有两个现今(Clade I 和Clade II)。已确认有西南地区海鲜美国市场接触巨著的6则有病症均集中的于在其中的一个分枝中的(Clade I),而Clade II病症无该接触巨著,提示COVID-19禽传染病的牵涉到并不一定以外西南地区海鲜美国市场。
新冠大肠杆菌基因进化树
接着,通过对禽传染病暴发的并不一定相同时长阶段和并不一定相同区域内病症的新冠大肠杆菌基因数列(截至2020年3月初)变异特征的比较分析,从武汉病则有分离的大肠杆菌基因中的识别了169个残基变动,其重复用到的突变与已公布的大肠杆菌数列一致,呈现较为稳定的进化过程,提示该大肠杆菌可能在禽传染病更早就已适应在永生宿主中的传播。同时他们发现, 新冠大肠杆菌两个现今的传播性、致病性和病理观感等方面无显著差异,未发现与COVID-19加护病症有显著系统性的大肠杆菌变异数列。
COVID-19病病症淋巴细胞变化
数据分析人员从病理和免疫学数据分析发现,COVID-19病症淋巴细胞显着减少,偏爱是加护病症CD4+和CD8+ T细胞呈显著进行性下降趋势,且炎性细胞因子IL-6和IL-8显着增高。COVID-19哮喘演进严重程度的决定状况主要与病症年龄、基础哮喘及淋巴细胞减少和系统性的细胞因子飓风密切系统性,为哮喘向加护演进的这两项预警因子。
这一数据分析结果意义独树一帜,对于进一步认清新型冠状大肠杆菌的分子疟疾特征、哮喘牵涉到演进特性,为加护病病症更早检验和治疗,以及为药物和抗生素研发提供了重要的参考资料依据。
此外,数据分析他的团队还向中的国国家组学数据集百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) ()、全球传染病数列数据集库(GISAID)和NCBI的全球性数列数据集库(SRA)递交了112个病则有的新冠大肠杆菌基因高质量数列数据集。同时,交通设施也搭建了重大哮喘大数据集网络服务新冠大肠杆菌基因数据集交互式、OpenBSD在线分析网站()。国内外高等院校和科学家均可完全共享系统性数据分析数据集。
原始出处:
Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020
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